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Genetische und umweltbedingte KrankheitsmechanismenForschung麻豆频道 & Forschungszentrum fr Molekulare BioMedizinForschungszentren und InstituteMed Uni Graz

Forschungsteam Mller

FORSCHUNGSSCHWERPUNKT INFORMATION SCIENCE AND MACHINE LEARNING

Teamleiter: Heimo Mller

Fokus: Der Fokus unserer Forschungsgruppe liegt in der Aufbereitung und Analyse von Daten, die im wissenschaftlichen und/oder diagnostischen Prozess entstehen (Fokus: Pathologie). Hierbei werden einerseits Werkzeuge entwickelt, die es erm枚glichen, Daten nach den FAIR-Prinzipien zu verarbeiten und andererseits bestehende Algorithmen (knstliche Intelligenz) analysiert und ihre Erklrbarkeit inkl. der Schnittstelle Mensch-Maschine dargestellt und weiterentwickelt (in Zusammenarbeit mit Andreas Holzinger). Ebenso werden im Zuge der Digitalisierung Archivproben der Biobank aufbereitet und in digitalen Katalogen bereitgestellt (in Zusammenarbeit mit Kurt Zatloukal).

Vernetzung: Wir kooperieren mit dem Institut fr 麻豆频道 Informatik, Statistik und Dokumentation, 麻豆频道 Universitt Graz sowie mit BBMRI-ERIC, BIOBANKS AND BIOMOLECULAR RESOURCES RESEARCH INFRASTRUCTURE CONSORTIUM

Projekte

AIDAVA

  • Um personenbezogene Gesundheitsdaten (PHD) interoperabel, KI-fhig und wiederverwendungsfhig zu machen, m枚chte das Projekt AIDAVA einen KI-gesttzten, virtuellen Assistenten entwickeln (getestet mit Krankenhusern), der die Automatisierung der Datenpflege maximiert und eine Ver枚ffentlichung von unstrukturierten und strukturierten, heterogenen Daten erm枚glicht. Der virtuelle Assistent enthlt ein Kurationstools mit KI-basierten personenbezogenen Daten auf die die Benutzer*innen zugreifen k枚nnen. Fokus liegt hier auf dem Brustkrebspatientenregister und Lngsschnitt-Gesundheitsakten fr Herz-Kreislauf-Patienten. Durch die zunehmende Automatisierung zur Verbesserung der Datenqualitt und Bereitstellung qualitativ hochwertiger Daten wird AIDAVA die Arbeitsbelastung klinischer Datenverwalter verringern, die Wirksamkeit der klinischen Versorgung verbessern und die klinische Forschung untersttzen.
  • Projektdauer: 2022-2026
  • Gef枚rdert durch: Europische Kommission
  • Projektpartner*innen: Universiteit Maastricht, b!loba, European Research and Project Office GmbH, Katholieke Universiteit Leuven, Sirma AI EAD, MIDATA Genossenschaft, The European Institute for Innovation through Health Data, Sihtasutus Pohja-Eesti Regionaalhaigla, Digi.me Limited, Gnome Design SRL, Averbis GmbH, European Cancer Patient Coalition, European Heart Network ASBL

Biobanking and the Cyprus Human Genome Project

  • Die genetische Untersuchung von Krankheiten und eHealth ist eine Prioritt von dem europischen Projekt CY-Biobanking und kann am besten durch die Schaffung eines Kompetenzzentrums in Zypern erreicht werden; als zeitgem脽e Biobank-Forschungsinfrastruktur und moderne Forschungseinrichtung zur Untersttzung des Projekts und zur F枚rderung der translat. Forschung mit Schwerpunkt auf genetisch bedingte Krankheiten. Das Projekt rstet die vorhandene Infrastruktur auf und implementiert Verfahren und QMS mit hohem Standard, um Daten und Material von h枚chster Vertrauenswrdigkeit fr sptere Untersuchungen zu schtzen.
  • Laufzeit: 2019-2027
  • Gef枚rdert durch: Europische Kommission
  • Projektpartner: University of Cyprus, BBMRI-ERIC, RTD Talos Limited

Smart FOX

  • Viele klinische Forschungsaktivitten in 脰sterreich stehen vor Herausforderungen aufgrund nicht verknpfbarer Datenquellen. Doch oft liegt der eigentliche Wert erst in der Vernetzung der Daten. Vor diesem Hintergrund werden in Smart FOX, Konzepte, Methoden und Tools entwickelt, um Brger*innen/Patient*innen M枚glichkeiten zur Spende ihrer Gesundheitsdaten fr die klinische Forschung bereitzustellen. Smart FOX verknpft ELGA-standardisierte Gesundheitsdaten mit klinischen Registern fr Dickdarmkrebs und Herzinsuffizienz und verbessert somit den Patienten*innenrekrutierungsprozess durch die Verknpfung von Dienstleistungen der Industrie mit den in Smart FOX entwickelten Datenspendenregistern. Letztendlich wird Smart FOX den Weg zu einer Brger*innen/Patient*innen-gesteuerten Spende von Gesundheitsdaten in 脰sterreich ebnen, um die Demokratisierung und vollstndige Nutzung der entlang des Patient*innenwegs gesammelten Daten zu erm枚glichen.
  • Projektdauer: 2023-2026
  • Gef枚rdert durch: FFG
  • Projektpartner*innen: AIT, G脰G, LBI DHPS, MUW, UMIT, UniVie, Dedalus, EIT, fragentiX, ITSV, Probando, SHS, TBM, LIV, DIO, Survivors AT

RI-Scale

  • Im Rahmen des Projekts wird ein verteiltes Netz von Expert*innen, ein Kompetenzzentrum, betrieben, ber das die DEP-Technologie (Plattformtechnologie zur Datenverwertung) konzipiert und zu einem Software-Prototyp und zugeh枚rigen Einsatz- und Betriebsanleitungen entwickelt wird, die es den RI (Forschungsinfrastruktur)-Datenbestnden erm枚glichen, ihr Portfolio mit gemeinsam bereitgestellten skalierbaren Rechendiensten auf e-Infrastrukturen zu erweitern. Hierdurch k枚nnen Datenstze aus den Datenbestnden repliziert und fr datenintensive Analysen angeboten werden. Das DEP wird eine vertrauenswrdige Datenreplikation und ein Lebenszyklusmanagement mit Minimierung des Energieverbrauchs in der gesamten Betriebskette fr 脺bertragung, Berechnung und Speicherung implementieren. Der Betrieb beruht auf kohrenten Identittsmanagement-, Authentifizierungs- und Autorisierungsl枚sungen, die das Vertrauen und die Interoperabilitt zwischen RIs, e-Infrastrukturen und dem entstehenden 脰kosystem der Datenrume gewhrleisten.
  • Projektdauer: 2025-2027
  • Gef枚rdert durch: EU
  • Projektpartner*innen: Stichting EGI, Masarykova Univerzita, TU Wien, fragmentiX, BBMRI-ERIC, EMBL, CERN, MMCI, DKRZ, Universitat Politecnica de Valencia

ONCOSCREEN

  • Da Darmkrebs (CRC) fr 12,4 % aller krebsbedingten Todesflle verantwortlich ist und nur 14 % der EU-Brger an Screening-Programmen teilnehmen, besteht ein dringender Bedarf an genauen, nicht-invasiven, kostengnstigen Screening-Tests auf der Grundlage von neuartigen Technologien und einem erh枚hten Bewusstsein fr die Krankheit und ihre Erkennung. Darber hinaus sind personalisierte Anstze fr das Screening erforderlich, um genetische und andere sozio枚konomische Variablen und Umweltstressoren zu bercksichtigen. ONCOSCREEN reagiert auf diese Herausforderungen durch die Entwicklung einer risikobasierten Stratifizierungsmethodik auf Bev枚lkerungsebene fr CRC, um die genetische Prvalenz, den sozio枚konomischen Status und andere Faktoren zu bercksichtigen. Das Projekt wird von einem multidisziplinren Konsortium aus 38 Partnern getragen, darunter Anbieter technischer L枚sungen, Krankenhuser, Gesundheitsministerien als politische Entscheidungstrger, Rechts- und Ethikexperten, Versicherungsunternehmen, und der aktiven Einbeziehung von Endnutzern/Brgern durch gezielte Workshops in allen Phasen der Umsetzung.
  • Projektdauer: 2023-2026
  • Gef枚rdert durch: Europische Kommission
  • Projektpartner*innen: EXUS Software Monoprosopi Etairia Periorismenis Evthinis, Universitaetsmedizin Der Johannes Gutenberg-Universitaet Mainz, Institute Of Communication And Computer Systems, Firalis, Universittsklinikum Schleswig-Holstein, Lietuvos Sveikatos Mokslu Universitetas, Technion 鈥� Israel Institute Of Technology, Time.Lex, Ethniko Kentro Erevnas Kai Technologikis Anaptyxis, CCASSURED, Universidad De La Rioja, Carr Communications Limited, Ministry Of Health- Greece, 麻豆频道 Universitt Innsbruck, Gercor u.a.

PRIVAGAMS

  • PRIVAGAMS schafft eine hochmoderne Plattform zur Generierung von datenschutzkonformen simulierten Daten unter Verwendung generativer gegnerischer Netzwerke (GANs). Sie gewhrleistet hochwertige, realistische Datenstze und schtzt gleichzeitig sensible Informationen, mit Anwendungen in klinischen, tabellarischen und Bilddaten. Das Projekt konzentriert sich auch auf die Bereinigung von Modellen fr maschinelles Lernen durch fortschrittliche Techniken wie Modelldestillation und Wasserzeichen, wodurch eine sichere Forschung ber verschiedene Forschungsinfrastrukturen hinweg erm枚glicht wird.
  • Projektdauer: 2024-2026
  • Gef枚rdert durch: Europische Kommission
  • Projektpartner*innen: TU Wien, Masaryk Universitt, Masaryk Memorial Cancer Institut

EUCAIM

  • Die EUropean Federation for CAncer IMages (EUCAIM) ist der Grundstein der von der Europischen Kommission initiierten European Cancer Imaging Initiative, einem Vorzeigeprojekt des europischen Plans zur Krebsbekmpfung (EBCP), dessen Ziel es ist, Innovationen und den Einsatz digitaler Technologien in der Krebsbehandlung und -versorgung zu f枚rdern, um przisere und schnellere klinische Entscheidungen, Diagnosen, Behandlungen und prdiktive Medizin fr Krebspatienten zu erm枚glichen. Das vierjhrige Projekt begann im Januar 2023 und vereint 76 Partner, um eine paneuropische digitale Infrastruktur fr FAIR-konforme, anonymisierte, realittsnahe Krebsbilder aufzubauen. Die Infrastruktur soll die Datenhoheit der Anbieter wahren und eine Plattform, einschlie脽lich eines Atlas von Krebsbildern, fr die Entwicklung und das Benchmarking von KI-Tools fr die Przisionsmedizin bereitstellen. EUCAIM wird die Fragmentierung bestehender Krebsbild-Repositorien angehen, indem es auf Repositorien der AI4HI-Initiative, europischen Forschungsinfrastrukturen und nationalen/regionalen Repositorien aufbaut und klinische Bilder, Pathologie-, Molekular- und Labordaten einbezieht.
  • Projektdauer: 2024-2026
  • Gef枚rdert durch: Europische Kommission
  • Projektpartner*innen: u.a. EIBIR, Universitat Politecnica de Valencia, Deutsches Krebsforschungszentrum Heidelberg (DKFZ), EATRIS, 麻豆频道 Universitt Wien, EURO-BIOIMAGING, STICHTING HEALTH-RI, Karolinska Institutet (KI), Philips GmbH, BBMRI-ERIC, Charit茅 Universittsmedizin Berlin, ELIXIR

麻豆频道- und Forschungsinstitut fr Pathologie

Dr.
Heimo Mller  
T: +43 316 385 71764
E: heimo.mueller(at)medunigraz.at

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