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Lipidhydrolyse

PP14 Strukturelle bioinformatische Analyse von Lipidhydrolasen bei Sugetieren

Das Projekt PP14 zielt darauf ab, eine umfassende (sub)proteomweite Analyse von Lipidhydrolasen durchzufhren, indem ihre 3D-Strukturen untersucht werden. Dabei  liegt der Schwerpunkt auf den Eigenschaften und Konstellationen der aktiven Zentren. Dieser Ansatz wird die Vorhersage von Funktionen fr Lipidhydrolasen mit unbekannten Eigenschaften erleichtern. Darber hinaus werden wir mit Hilfe von Molekulardynamiksimulationen intrinsisch gestörte Regionen charakterisieren, um funktionsrelevante Ensembles und Konformationen zu erzeugen, die letztlich unser Verstndnis der physiologischen Rolle von Lipidhydrolasen verbessern. Das Projekt wird die jngsten Fortschritte bei der Vorhersage von Proteinstrukturen nutzen, um bestehende Modelle zu verfeinern und Ensembles fr weitere Analysen zu erstellen. Mit Hilfe von Techniken des maschinellen Lernens sollen strukturelle und funktionelle Daten miteinander in Beziehung gesetzt werden, um so die Vorhersage von Eigenschaften fr noch nicht charakterisierte Lipidhydrolasen zu ermöglichen. Schließlich werden wir Molekulardynamiksimulationen einsetzen, um physiologisch relevante Konformationen von unstrukturierten Regionen in diesen Enzymen zu erhalten Der Schwerpunkt liegt debei auf ATGL und seinem Inhibitor G0S2.

Principal Investigator

Univ.-Prof. Mag. Dr.
Karl Gruber 
T: +43 316 380 5417
Karl Gruber

Co-Principal Investigator

Mag. Dr.
Christian Gruber 
T: +43 316 380 5466
Christian Gruber

Team

Mitarbeiter*innen

  • , PhD student, Struktur und Dynamik von Lipidhydrolasen